Berdirinya Rumah Sakit PKU Aisyiyah Jepara merupakan keinginan besar dari sebagian orang – orang Islam dan atau khususnya anggota Aisyiyah - Muhamadiyah Jepara untuk mempunyai Rumah Sakit yang bernafaskan Islam. Pimpinan Aisyiyah Daerah Kabupaten Jepara pada tahun 1982 mendirikan Balai Pengobatan yang berlokasi di Desa Kauman. Menurut perkembangan operasional, Balai Pengobatan Siti Khodijah Jepara hingga saat ini dibagi menjadi 6 periode.
Visi RS PKU Aisyiyah Jepara adalah Terselenggaranya Amal Usaha Dalam Bidang Kesehatan Yang Profesional dan Islami Dalam Perwujudan Rahmatan Lil Alamin
MISI RS PKU Aisyiyah Jepara
1. Menjadikan amal usaha kesehatan sebagai sarana ibadah untuk melaksanakan dakwah amar ma’ruf nahi munkar
2. Menjadikan amal usaha kesehatan sebagai sarana untuk memberikan pelayanan kepada umat dan mendukung pengembangan dakwah jamaah.
Tujuan RS PKU Aisyiyah Jepara
1. Terwujudnya pelayanan kesehatan yang profesional, berkemajuan, tepat waktu, tepat sasaran, tepat pilihan dan tepat biaya.
2. Terwujudnya nilai-nilai peradaban Islam dalam lingkungan Rumah Sakit sebagai sarana dakwah.
3. Sebagai amal usaha profit untuk menghidupi persyarikatan dan menyejahterakan masyarakat.